熒光探針?lè)≒CR試劑盒利用吸附柱提取RNA作為模板,在反轉(zhuǎn)錄酶的作用下,以引物為起點(diǎn)合成與RNA模板互補(bǔ)的cDNA鏈;然后在DNA聚合酶的作用下,經(jīng)高溫變性、低溫退火和中溫延伸的多次循環(huán),使特異DNA片段的拷貝數(shù)放大數(shù)百萬(wàn)倍。將擴(kuò)增的DNA片段進(jìn)行電泳、染色后,在紫外燈下,肉眼可見(jiàn)DNA片段的擴(kuò)增帶。
一、樣品制備
樣品采集::病死或撲殺的禽,取肺、脾、腦等組織;待檢活禽,用棉拭子取呼吸道分泌物,放于50%甘油生理鹽水中或用注射器取血5mL,2~8℃保存。(要求送檢病料新鮮,嚴(yán)禁反復(fù)凍融。)
組織樣品的處理:稱取組織0.1g于研磨器中磨碎,再加1mL生理鹽水繼續(xù)磨至無(wú)塊狀物;然后將樣品轉(zhuǎn)至1.5mL滅菌離心管中,8000rpm離心2min,取100µL上清于1.5mL滅菌離心管中。2樣品處理:
全血樣品的處理:待血凝后取100µL血清于1.5mL滅菌離心管中。
陽(yáng)性對(duì)照的處理:取陽(yáng)性對(duì)照100µL于1.5mL滅菌離心管中。
陰性對(duì)照的處理:取陰性對(duì)照100µL于1.5mL滅菌離心管中。
二、病毒RNA的提取
取已處理的樣品、陰性對(duì)照和陽(yáng)性對(duì)照,分別加入450µL裂解液,充分顛倒混勻,室溫靜置3min。
加入275µL無(wú)水乙醇,輕輕混勻。
將混合液吸入吸附柱中(吸取液體時(shí)盡量不要吸到懸浮雜質(zhì),以免離心時(shí)堵塞吸附柱),10,000rpm離心1min,棄去收集管中液體,套回收集管。
向吸附柱中加入500µL洗滌液A,10,000rpm離心1min,棄去收集管中液體,套回收集管。
向吸附柱中加入500µL洗滌液B,10,000rpm離心1min,棄去收集管中液體,套回收集管。
空柱10,000rpm離心2min。
將吸附柱移入新的無(wú)RNA酶的1.5mL離心管中,在膜中央加入30µL洗脫液,室溫靜置2min,10,000rpm離心1min,獲得總RNA。
三、RT-PCR
反應(yīng)體系:分別取14µLRT-PCR反應(yīng)液A(用前混勻)、4µLRT-PCR反應(yīng)液B(用前混勻)和2µL模板RNA,混勻。
反應(yīng)程序:在PCR儀上運(yùn)行以下程序:42℃45min,94℃3min;94℃30s、53℃30s、72℃30s,35個(gè)循環(huán);72℃延伸10min。
四、電泳
制膠:用50倍稀釋的TAE電泳緩沖液配制1%瓊脂糖凝膠。
電泳:待膠凝固后,取5µLPCR擴(kuò)增產(chǎn)物點(diǎn)樣于瓊脂糖凝膠孔中,以5V/cm的電壓于50倍稀釋的TAE電泳緩沖液中電泳。
染色:取50倍稀釋的TAE電泳緩沖液30mL,加入10µL染色液,混勻后將膠浸泡30min,于紫外燈下觀察結(jié)果。
【結(jié)果判斷】
陽(yáng)性對(duì)照出現(xiàn)400bp擴(kuò)增帶,陰性對(duì)照無(wú)帶出現(xiàn)(引物帶除外)時(shí),實(shí)驗(yàn)結(jié)果成立。被檢樣品出現(xiàn)400bp擴(kuò)增帶為新城疫病毒陽(yáng)性,否則為陰性。
【需用但未提供的材料】
組織研磨器、眼科剪、眼科鑷、一次性注射器、瓊脂糖、經(jīng)焦碳酸二乙酯(DEPC)處理的滅菌1.5mL離心管和吸頭(10µL、200µL、1000µL)。